肉種（豚・牛・羊・鶏）判別キットを作ってみた

ここのところ、「すにっぷすいすい」　のご依頼が少なく、

DNAのわずかな違いを識別するプライマー設計の腕が鈍りそうだったので、

肉の種類を識別するプライマーというのを作ってみました。

（肉種鑑別キット自体は、既存品もあるので目新しいものではありませんが、

特許出願されている塩基配列を避けて、オリジナルで作成してみました）

作り方は、

①豚、牛、鶏、羊、鹿、ウサギ、馬のそれぞれについて、

よく読まれている遺伝子の配列をデータベースから引っ張ってくる

（ここではチトクロームC遺伝子を使い、それぞれについて別々に読まれた

３つ以上のデータを使い、種内変異を拾わないように気をつけました）

②引っ張ってきたデータのアライメントをとる

③それぞれの種で特異的になる配列を見つけ、そこでプライマーを設計する

④豚、牛、鶏、羊、鹿、ウサギ、馬のそれぞれについて、

保存性が非常に高い遺伝子の配列をデータベースから引っ張ってくる

（ここではβアクチン遺伝子を使いました）

⑤今度は、すべてにおいて共通となる配列を見つけ、そこでプライマーを設計する

（DNA抽出の成否を判定するための陽性対照＝ポジコン用プライマーになります）

⑥信頼できるお肉やさんで買ってきたお肉からDNAを抽出し、PCRをかけてみる

（DNA抽出は「DNAすいすい-F」で行いました）

⑦予想通りの結果になればOK！

今回は、（肉が入手できる）牛、豚、鶏、羊の４種類とポジコンのみ、

プライマーを合成して試すことにしました。

増幅断片長は、

　ポジコン：２４３bp

　牛：３２１bp

　豚：３３４bp

　鶏：５３１bp

　羊：３３１bp

です。

では、テストの結果です。

【お肉料理のヒントもご一緒に・・・】

まずは豚。

材料は自家製のパンチェッタ（豚ばらかたまり肉の塩漬け）。

【カルボナーラは市販のベーコンじゃなく、これを厚くスライスしたもので作ると、

本格的な味わいのご馳走になります。

他にもいろいろな料理に使えてすごく便利なので、作っておくといいですよ～。】

対照と豚用だけ増えてます。

このパターンでOKです。

次に、牛肉。

近江牛のシチュー用肉・・・ビーフシチューになる前に取り分けて抽出しました。

【ビーフシチュー、市販のルーで作る場合も、水の１～２割を赤ワインにするとぐっと深みが増します。

時間がかかる印象がありますが、圧力鍋があれば、帰宅してから作り始めても夕食に間に合います。

カレーのように、ご飯と一緒に食べてもおいしいですよ～。】

対照と牛用だけ増えています。

これもOKですね。

次に羊です。

ニュージーランド産の骨付きラム肉があったのでそれで。

【たたいて薄く展ばし、細かくしたパン粉で「コトレッタ」（ミラノ風カツレツ）にして、

ラタトイユをソース代わりにして食べるのが大好きです。ああ、よだれが出そう・・・。】

若干増幅が弱いですが、リーズナブルな結果です。

（牛用と鶏用のところに見えているバンドは、非特異的なものなので無視。）

次に鶏肉。

うっかりサンプリングの前に料理してしまったため、「鶏そぼろ」から抽出。

【ちなみに鶏そぼろには、鶏ひき肉２００グラムに対し、たたいた梅干１個分と、

九州人なら外せない「柚子胡椒」を耳かき１杯分、隠し味に入れるとおいしいです。】

調理済みの材料ですが、DNA、取れてるでしょうか？

おお、ちゃんと取れてました。

対照と鶏用のみ増幅で、パターンもOKです。

というわけで、４種類とも大丈夫なようです。ポジコン（対照）もすべて増えてます。

では、冷蔵庫にあるものでもう少し。

まずはウインナーソーセージ。パキッといい音がする、あの銘柄です。

さすがに豚肉だけ増えました。

もうひとつ、パック入りのハムです。

ドラッグストアのチルドコーナーですごく安く売っていたものなので、ちょっと不安。

こちらもちゃんと豚だけ増えました。

ちょっとつまらない結果ですね・・・。

合いびき肉で作ったハンバーグとかで試せばよかったです。

以上、いかにも簡単にできたように書いてますが・・・

実際には、マルチバンドになったり増幅しなかったりで、

２～３回設計しなおしたプライマーもあり、それなりに苦労しております。

鹿、馬、ウサギのプライマーも設計してあるので、肉が手に入ったら、

それらもやってみたい！と思います。

（その前に、ご注文がたくさんきて忙しくなる方がいいのですけれどね）

今夜はお肉料理で決まりですね！

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