脂質の多い種子からのDNA抽出（続き）

前回の記事で、

菜花の種、ひまわりの種（中身）、かぼちゃの種（中身）から、

DNAすいすい-Lを使って、DNAを抽出してみました。

まずは濃度測定。

菜花の種（10粒からスタート→50μlに溶解）

・核酸濃度：700ng/μl

・260／280比：1.96

ひまわりの種（中身1粒分からスタート→50μlに溶解）

・核酸濃度：657ng/μl

・260／280比：1.92

かぼちゃの種（中身4分の1粒分からスタート→50μlに溶解）

・核酸濃度：202ng/μl

・260／280比：1.85

RNAも含まれる抽出法なので、「核酸濃度」としました。

ちなみに波形は、いずれも260nmにピークがあるきれいな波形でした。

次に電気泳動で見てみます。0.8％のアガロースゲルに、10μl分を載せて泳動。

左から、菜花、ひまわり、かぼちゃ。

右端は、DNAすいすい-Sで米2粒から抽出したDNAです（参考）。

米に比べると、他の種子では含まれるDNAの量がだいぶ多いことがわかります。

ゲノムDNAは一番上のバンド。

中央あたりのバンドはRNAで、最下段のバンドはおそらく多糖類かと思います。

これで、DNAが取れていることは確認できました。

次に、取れたDNAでPCR実験ができるかどうか？を確かめます。

プライマーは、植物なら何でも増える１８S用のオリジナルプライマー（214bp増幅）です。

鋳型として、得られたDNA溶液、15倍希釈、225倍希釈を各1μl用いました。

どれも増えました！

原液のままだと若干弱いものもありますので、

ある程度薄めて使うのがよいようです。

すりつぶすと、ねっとりペースト状になってしまうような脂質の多い種子からでも、

簡単な手順で十分なクオリティのDNAを抽出することができました。

開発時点での確認実験では、

落花生やゴマのほか、

（焙煎して塩味をつけた）スナック用のアーモンドやピーナツ、

マカデミアナッツ、カシューナッツ、ジャイアントコーン、

それになんと「ピーナッツバター」からも、

DNAが取れています（取説にデータあり）。

発芽させて葉っぱからDNA抽出すれば比較的簡単ですが、

発芽には時間がかかりますし、そもそも発芽しないものもあります。

そういう材料からのDNA抽出が必要なときには、DNAすいすい-Lをお試しください。

・・・ところで、今回の結果を見る限り、プロトコルの工夫でRNAも取れそうな気配です。

いずれ検討してみようと思っています。

こちらもご期待ください。

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