Dとれプロ③パパイヤとバナナ

「DNAすいすいシリーズで、こんなものからDNAがとれるかな？」プロジェクト、

略して「Dとれ」プロ、第3弾「パパイアとバナナ」編です。
　
パパイヤです。

バナナです。

バナナは食べる部分（果肉）と、皮とがあるので、別々に約50mgをサンプリング。

パパイアも食べる部分（果肉）と、果肉もくっついてきてしまいますが皮の部分に分け、

同じく約50mgをサンプリングしました。

試薬の方は、

「澱粉や糖の多い植物組織向け」の「DNAすいすい-S」と、

「ポリフェノールの多い植物組織向け」の「DNAすいすい-P」を

両方試してみます。

プロトコールはいつもと同様に、

400μl（Pは360μｌ＋添加剤40μｌ）のバッファー中でつぶし、

100μlのフェノクロを加えて混合後、遠心。

200μｌの上清をとり、等量のイソプロと混合して再度遠心。

沈殿を70％エタノールでリンスして完了です。
　

　
20μlの水に溶解し、3μlを泳動してみました。

すると・・・

なんと、パパイヤの果肉と皮からは、RNAがたっぷり取れていました。

RNaseノーマークの抽出・泳動だったので意表を突かれました・・・。

パパイヤにはRNase阻害物質が含まれているのかもしれないですね。

それはそれで面白いですが、気を取り直して先に進みます。

バナナは、この泳動では、Sの方でうっすらゲノムらしきものが見えています。

次に、おなじみとなりました、植物なら何でも増える18S用プライマー（リーゾオリジナル）で

PCRをかけてみました。

とりあえず10倍希釈1μlを鋳型として、40サイクルの反応です。

泳動してみますと、このようになりました。　

　

＜結果＞

・パパイヤの果肉はS、PともOK

・パパイヤの皮はPのみOK

・バナナの果肉、皮はSのみOK

希釈倍率を上げて再度PCRをしてみたところ、

パパイヤの皮（S)、バナナの皮（P）も増幅しました。

（データは省略させていただきます！）

結論として、

・パパイヤは皮、果肉とも、SでもPでもOK

・バナナは、皮ならPでもいけますが、Sがお勧め

ということになりました。

なお、バナナ果肉は「RNAすいすい-S」でRNAが取れることを確認済みです。

パパイヤは「RNAすいすい」を試していませんが、

今回の結果を見る限り「RNAすいすい-S」で問題なく抽出できそうです。

パパイヤなんて滅多に買わないので、よい機会と思い使ってみましたが、

生の果物はDNA抽出できて当然といえば当然ですね・・・。

次回は、もう少し難しい材料にトライしてみます。

今回使いました、「DNAすいすい-S」「DNAすいすい-P」のご案内はこちらです。
http://rizo.co.jp/DNA-S.html

http://rizo.co.jp/DNA-P.html