イグサDNA鑑定始めました②原理

（イグサ鑑定の話の続きです。初めての方は①背景からどうぞ。）

今回は、DNA鑑定の原理について説明します。

DNA鑑定は、一般的に、ゲノムDNA配列上にあるわずかな違いを探してきて、

比較対象となる品種（あるいは個体、サンプル）どうしでその部分を比較することにより、

どちらのタイプであるのかを決定するという方法で行います。

（ちなみに「ゲノム」とは遺伝子geneと染色体chromosomeの合体語で、

ある生物が生活環をまっとうするのに必要となるひとそろいのDNA、

などと説明されます。）

「わずかな違い」は、例えば一塩基置換（文章で言えば誤植のような感じ）や、

繰り返し配列の繰り返し回数の違い、

あるいは一部が抜けている（逆から見れば余計なものが入っている）、

などの形で見つかります。

イグサの「ひのみどり」と「それ以外の品種」の間にも、このような違いが複数あるので、

その部分をコントロールと比較すれば、どちらのタイプなのかがわかります。

具体的には、polymerase chain reaction（PCR）という反応を行って、

「違い」のある部分だけを何百万倍にも増やし、

アガロースゲル電気泳動で増幅した断片の長さと本数を調べます。

「ひのみどり」では1本、「それ以外」では2本の断片が出てきますので、

それで判定できるわけです。

ここで難しい問題があります。

「ひのみどりではない」という判定は、たった1箇所を調べるだけで、

確実に下すことができます。

1箇所でもDNAの配列が違えば、（たとえ「ひのみどり」にものすごく近い品種だとしても）

「ひのみどりとは違う」と言い切れるのです。

ところが逆に、「これはひのみどりです」という判定は、

どこまで調べても確実に下すことはできません。

しかし、そうもいっていられないため、現実的な対応として、

ゲノム上の5箇所を調べて全て「ひのみどり」と同じタイプであれば、

「ひのみどりであると強く疑われる」という結果を報告することになっています。

実際には、「ひのみどりではない」ことを低コストで確認したいというケース

（主に畳表・乾燥イグサの輸入・製造・販売業の方など）と、

育成者権を守るため、怪しいイグサについてしっかり検査したいというケース

（主に日本国内の生産者や税関関係者の方など）と、

DNA鑑定が必要な立場は、大きくふたつに分かれます。

リーゾでは、どちらの立場のお客様にも対応させていただいています。

次回は、お客様のニーズに合わせたサービスのご紹介をします。

（以下③に続きます！）

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